Protein–RNA interactions for Protein: Q86UG4

SLCO6A1, Solute carrier organic anion transporter family member 6A1, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO6A1Q86UG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLCO6A1Q86UG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLCO6A1Q86UG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO6A1Q86UG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms