Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSX7Q7RTT5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX7Q7RTT5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSX7Q7RTT5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX7Q7RTT5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms