Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BRINP3Q76B58 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BRINP3Q76B58 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
BRINP3Q76B58 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BRINP3Q76B58 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BRINP3Q76B58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
BRINP3Q76B58 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BRINP3Q76B58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BRINP3Q76B58 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BRINP3Q76B58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
BRINP3Q76B58 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
BRINP3Q76B58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
BRINP3Q76B58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BRINP3Q76B58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
BRINP3Q76B58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRINP3Q76B58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRINP3Q76B58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BRINP3Q76B58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms