Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQR2

CFAP77, Cilia- and flagella-associated protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP77Q6ZQR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP77Q6ZQR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP77Q6ZQR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP77Q6ZQR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP77Q6ZQR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP77Q6ZQR2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP77Q6ZQR2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP77Q6ZQR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP77Q6ZQR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP77Q6ZQR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP77Q6ZQR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms