Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SAMD1Q6SPF0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SAMD1Q6SPF0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SAMD1Q6SPF0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SAMD1Q6SPF0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMD1Q6SPF0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SAMD1Q6SPF0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms