Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP78Q5JTW2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP78Q5JTW2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP78Q5JTW2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEP78Q5JTW2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEP78Q5JTW2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEP78Q5JTW2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEP78Q5JTW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms