Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMC4Q5J8M3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMC4Q5J8M3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC4Q5J8M3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms