Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ODF2Q5BJF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ODF2Q5BJF6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ODF2Q5BJF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ODF2Q5BJF6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms