Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NCBP3Q53F19 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCBP3Q53F19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NCBP3Q53F19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NCBP3Q53F19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCBP3Q53F19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCBP3Q53F19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCBP3Q53F19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCBP3Q53F19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCBP3Q53F19 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCBP3Q53F19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCBP3Q53F19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCBP3Q53F19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCBP3Q53F19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCBP3Q53F19 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms