Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PAN2Q504Q3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAN2Q504Q3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAN2Q504Q3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAN2Q504Q3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PAN2Q504Q3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAN2Q504Q3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAN2Q504Q3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PAN2Q504Q3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAN2Q504Q3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAN2Q504Q3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAN2Q504Q3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms