Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMM50Q3ZCQ8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMM50Q3ZCQ8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM50Q3ZCQ8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIMM50Q3ZCQ8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms