Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
KRTAP21-3Q3LHN1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRTAP21-3Q3LHN1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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