Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA3Q16787 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMA3Q16787 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LAMA3Q16787 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMA3Q16787 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA3Q16787 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA3Q16787 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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