Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB30Q15771 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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RAB30Q15771 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB30Q15771 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB30Q15771 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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RAB30Q15771 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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RAB30Q15771 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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RAB30Q15771 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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RAB30Q15771 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB30Q15771 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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RAB30Q15771 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB30Q15771 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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RAB30Q15771 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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RAB30Q15771 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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RAB30Q15771 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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RAB30Q15771 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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RAB30Q15771 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB30Q15771 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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