Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SKIV2LQ15477 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SKIV2LQ15477 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SKIV2LQ15477 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2LQ15477 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms