Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3A2Q15428 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SF3A2Q15428 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SF3A2Q15428 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3A2Q15428 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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