Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAB3GAP1Q15042 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RAB3GAP1Q15042 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RAB3GAP1Q15042 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
RAB3GAP1Q15042 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAB3GAP1Q15042 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB3GAP1Q15042 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
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