Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1DQ13901 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1DQ13901 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1DQ13901 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1DQ13901 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1DQ13901 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1DQ13901 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1DQ13901 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1DQ13901 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1DQ13901 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1DQ13901 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1DQ13901 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1DQ13901 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1DQ13901 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1DQ13901 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1DQ13901 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1DQ13901 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1DQ13901 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1DQ13901 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1DQ13901 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1DQ13901 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1DQ13901 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1DQ13901 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1DQ13901 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C1DQ13901 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1DQ13901 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1DQ13901 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1DQ13901 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1DQ13901 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1DQ13901 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1DQ13901 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1DQ13901 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1DQ13901 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1DQ13901 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1DQ13901 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1DQ13901 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1DQ13901 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1DQ13901 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1DQ13901 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1DQ13901 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1DQ13901 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1DQ13901 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1DQ13901 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1DQ13901 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1DQ13901 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1DQ13901 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1DQ13901 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1DQ13901 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1DQ13901 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1DQ13901 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1DQ13901 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1DQ13901 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1DQ13901 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1DQ13901 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1DQ13901 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1DQ13901 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1DQ13901 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1DQ13901 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1DQ13901 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1DQ13901 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C1DQ13901 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1DQ13901 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1DQ13901 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1DQ13901 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C1DQ13901 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1DQ13901 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1DQ13901 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1DQ13901 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1DQ13901 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1DQ13901 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1DQ13901 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1DQ13901 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1DQ13901 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1DQ13901 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1DQ13901 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1DQ13901 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1DQ13901 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1DQ13901 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1DQ13901 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1DQ13901 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1DQ13901 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1DQ13901 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1DQ13901 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1DQ13901 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1DQ13901 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1DQ13901 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1DQ13901 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C1DQ13901 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1DQ13901 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1DQ13901 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1DQ13901 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1DQ13901 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1DQ13901 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1DQ13901 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1DQ13901 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1DQ13901 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1DQ13901 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1DQ13901 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1DQ13901 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1DQ13901 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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