Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
SHROOM2Q13796 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SHROOM2Q13796 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC42■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
SHROOM2Q13796 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
SHROOM2Q13796 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SHROOM2Q13796 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SHROOM2Q13796 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SHROOM2Q13796 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
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