Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms