Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB3Q13509 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB3Q13509 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB3Q13509 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB3Q13509 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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