Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPC3Q13507 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC3Q13507 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC3Q13507 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC3Q13507 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC3Q13507 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC3Q13507 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC3Q13507 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC3Q13507 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPC3Q13507 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPC3Q13507 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPC3Q13507 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPC3Q13507 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPC3Q13507 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC3Q13507 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC3Q13507 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC3Q13507 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC3Q13507 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC3Q13507 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC3Q13507 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC3Q13507 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC3Q13507 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC3Q13507 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC3Q13507 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC3Q13507 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC3Q13507 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC3Q13507 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPC3Q13507 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPC3Q13507 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPC3Q13507 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPC3Q13507 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPC3Q13507 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPC3Q13507 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPC3Q13507 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRPC3Q13507 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC3Q13507 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC3Q13507 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC3Q13507 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC3Q13507 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC3Q13507 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPC3Q13507 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPC3Q13507 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
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