Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
XRCC4Q13426 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XRCC4Q13426 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XRCC4Q13426 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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