Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGEF5Q12774 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ARHGEF5Q12774 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ARHGEF5Q12774 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARHGEF5Q12774 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
ARHGEF5Q12774 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
ARHGEF5Q12774 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF5Q12774 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
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