Protein–RNA interactions for Protein: Q12142

ATG9, Autophagy-related protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG9Q12142 BUD31YCR063W 474 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 GLY1YEL046C 1164 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 NME1NME1 340 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 LRO1YNR008W 1986 nt8.68□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 CYC3YAL039C 810 nt8.67□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 YLR460CYLR460C 1131 nt8.67□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 TIF3YPR163C 1311 nt8.67□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 DIP5YPL265W 1827 nt8.66□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 NDE2YDL085W 1638 nt8.66□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 SRP102YKL154W 735 nt8.66□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 YNL140CYNL140C 570 nt8.66□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 MET30YIL046W 1923 nt8.66□□□□□ -1.02
ATG9Q12142 ERO1YML130C 1692 nt8.64□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 ILV2YMR108W 2064 nt8.63□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 TGL5YOR081C 2250 nt8.63□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 SLM3YDL033C 1254 nt8.63□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 CHS7YHR142W 951 nt8.63□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 PDC6YGR087C 1692 nt8.62□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 INM1YHR046C 888 nt8.62□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 YNL190WYNL190W 615 nt8.62□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 TDA4YJR116W 840 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 OLA1YBR025C 1185 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 WSC4YHL028W 1818 nt8.61□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 AIM34YMR003W 597 nt8.6□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 PMT7YDR307W 1989 nt8.59□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 OCH1YGL038C 1443 nt8.59□□□□□ -1.03
ATG9Q12142 CHA1YCL064C 1083 nt8.58□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 YCR025CYCR025C 411 nt8.58□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 ARO3YDR035W 1113 nt8.58□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 SER2YGR208W 930 nt8.57□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 SHC1YER096W 1539 nt8.56□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 CAK1YFL029C 1107 nt8.56□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 YGR210CYGR210C 1236 nt8.56□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 YJL064WYJL064W 396 nt8.56□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 SEN2YLR105C 1134 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 YMR166CYMR166C 1107 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 MRP7YNL005C 1116 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 YPL264CYPL264C 1062 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 RHO1YPR165W 630 nt8.55□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 ALG7YBR243C 1347 nt8.54□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 RCF1YML030W 480 nt8.54□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 LAS17YOR181W 1902 nt8.54□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 WSC3YOL105C 1671 nt8.53□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 KTR4YBR199W 1395 nt8.53□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 MET13YGL125W 1803 nt8.53□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 NAP1YKR048C 1254 nt8.53□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 HXT8YJL214W 1710 nt8.53□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 PRC1YMR297W 1599 nt8.52□□□□□ -1.04
ATG9Q12142 THI73YLR004C 1572 nt8.52□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 DTR1YBR180W 1719 nt8.51□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 PUP3YER094C 618 nt8.51□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.51□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.51□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.51□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 ELP6YMR312W 822 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 LSP1YPL004C 1026 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 ITR1YDR497C 1755 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 HTS1YPR033C 1641 nt8.5□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 SPE4YLR146C 903 nt8.49□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 PAU19YMR325W 375 nt8.49□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 YPL108WYPL108W 507 nt8.49□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 PMT1YDL095W 2454 nt8.49□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 TOK1YJL093C 2076 nt8.49□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.48□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 RRT14YIL127C 621 nt8.48□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 YGR137WYGR137W 375 nt8.47□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 TPO1YLL028W 1761 nt8.46□□□□□ -1.05
ATG9Q12142 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.46□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 RFC1YOR217W 2586 nt8.45□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 MTC6YHR151C 1581 nt8.45□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 SNP1YIL061C 903 nt8.45□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 ALR1YOL130W 2580 nt8.44□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 BEM1YBR200W 1656 nt8.44□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 ATP10YLR393W 840 nt8.44□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 ERG6YML008C 1152 nt8.44□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 YER152CYER152C 1332 nt8.43□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 YPT31YER031C 672 nt8.42□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 HXT9YJL219W 1704 nt8.42□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 SGF73YGL066W 1974 nt8.42□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 TOM71YHR117W 1920 nt8.41□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 RRT6YGL146C 936 nt8.41□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 FCY1YPR062W 477 nt8.41□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 TIM50YPL063W 1431 nt8.4□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 AVL9YLR114C 2295 nt8.4□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 PET18YCR020C 648 nt8.4□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 SWM1YDR260C 513 nt8.4□□□□□ -1.06
ATG9Q12142 TOP3YLR234W 1971 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG9Q12142 CDA1YLR307W 906 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG9Q12142 YMR253CYMR253C 1245 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG9Q12142 BXI1YNL305C 894 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG9Q12142 PUP1YOR157C 786 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG9Q12142 PRE10YOR362C 867 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG9Q12142 PDC5YLR134W 1692 nt8.39□□□□□ -1.07
ATG9Q12142 JHD1YER051W 1479 nt8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.1 ms