Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 RRT6YGL146C 936 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 SPE4YLR146C 903 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 MRP7YNL005C 1116 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 ALG7YBR243C 1347 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 RNA170RNA170 169 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 ALR1YOL130W 2580 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 ENO1YGR254W 1314 nt7.03□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 TPO1YLL028W 1761 nt7.03□□□□□ -1.28
ATG41Q12048 TOP3YLR234W 1971 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 MOB1YIL106W 945 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 RCF1YML030W 480 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 ELP6YMR312W 822 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 WSC3YOL105C 1671 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 RSC9YML127W 1746 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 ATP10YLR393W 840 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 YLR460CYLR460C 1131 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 ERG6YML008C 1152 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 DTR1YBR180W 1719 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 MTC6YHR151C 1581 nt7□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 MET22YOL064C 1074 nt7□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 AVL9YLR114C 2295 nt7□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 PDC5YLR134W 1692 nt7□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 TOK1YJL093C 2076 nt6.99□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 FRE6YLL051C 2139 nt6.98□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 IGD1YFR017C 588 nt6.98□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 CKB1YGL019W 837 nt6.98□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 CHS7YHR142W 951 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 PEX28YHR150W 1740 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 YMR253CYMR253C 1245 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 OLA1YBR025C 1185 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 ERR3YMR323W 1314 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 ERR1YOR393W 1314 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 ERR2YPL281C 1314 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 SHC1YER096W 1539 nt6.96□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 HXT8YJL214W 1710 nt6.96□□□□□ -1.29
ATG41Q12048 YGR137WYGR137W 375 nt6.96□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 CPD1YGR247W 720 nt6.96□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 YLR030WYLR030W 792 nt6.96□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 PDC6YGR087C 1692 nt6.96□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 RFC1YOR217W 2586 nt6.96□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 SNP1YIL061C 903 nt6.95□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 STE4YOR212W 1272 nt6.95□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 RHO1YPR165W 630 nt6.95□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 SNA3YJL151C 402 nt6.94□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 CDA1YLR307W 906 nt6.94□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 RUP1YOR138C 2016 nt6.94□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 TES1YJR019C 1050 nt6.93□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 THI73YLR004C 1572 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 PUP3YER094C 618 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 FLX1YIL134W 936 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 YLR280CYLR280C 351 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 YLR349WYLR349W 507 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 OCH1YGL038C 1443 nt6.91□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 YKR018CYKR018C 2178 nt6.91□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 PMA2YPL036W 2844 nt6.9□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 GGC1YDL198C 903 nt6.9□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 PAU5YFL020C 369 nt6.9□□□□□ -1.3
ATG41Q12048 FRT1YOR324C 1809 nt6.9□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 YBL113CYBL113C 2379 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 SRP102YKL154W 735 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 SAM50YNL026W 1455 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 RCF2YNR018W 675 nt6.88□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 TOM71YHR117W 1920 nt6.88□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 AQR1YNL065W 1761 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 POB3YML069W 1659 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 LEO1YOR123C 1395 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 MAL31YBR298C 1845 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 ERO1YML130C 1692 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 CAK1YFL029C 1107 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 HAM1YJR069C 594 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 CYC3YAL039C 810 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 AOS1YPR180W 1044 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 YER137CYER137C 447 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 GNA1YFL017C 480 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 YOR041CYOR041C 432 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 PGC1YPL206C 966 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 IPL1YPL209C 1104 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 VPS65YLR322W 315 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG41Q12048 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.83□□□□□ -1.32
ATG41Q12048 DST1YGL043W 930 nt6.83□□□□□ -1.32
ATG41Q12048 YMR166CYMR166C 1107 nt6.83□□□□□ -1.32
ATG41Q12048 DCR2YLR361C 1737 nt6.83□□□□□ -1.32
ATG41Q12048 PRB1YEL060C 1908 nt6.83□□□□□ -1.32
ATG41Q12048 RMD8YFR048W 1989 nt6.82□□□□□ -1.32
ATG41Q12048 RPL12BYDR418W 498 nt6.82□□□□□ -1.32
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