Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC15Q0P6D6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC15Q0P6D6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC15Q0P6D6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC15Q0P6D6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms