Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD300CQ08708 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD300CQ08708 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD300CQ08708 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD300CQ08708 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD300CQ08708 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms