Protein–RNA interactions for Protein: Q08285

RRP40, Exosome complex component RRP40, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP40Q08285 YIR035CYIR035C 765 nt7.64□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 YJL160CYJL160C 864 nt7.64□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 YLR173WYLR173W 1827 nt7.64□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 OCH1YGL038C 1443 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 MET22YOL064C 1074 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 LSP1YPL004C 1026 nt7.63□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 HBS1YKR084C 1836 nt7.62□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 RTG2YGL252C 1767 nt7.62□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 AAT1YKL106W 1356 nt7.61□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 CAK1YFL029C 1107 nt7.61□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 RNA170RNA170 169 nt7.61□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 BUB2YMR055C 921 nt7.61□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 LPD1YFL018C 1500 nt7.61□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 THI6YPL214C 1623 nt7.6□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 PET18YCR020C 648 nt7.6□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 YJR149WYJR149W 1215 nt7.6□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 PDC6YGR087C 1692 nt7.6□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 YBR056WYBR056W 1506 nt7.59□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 RRT14YIL127C 621 nt7.59□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 OLA1YBR025C 1185 nt7.59□□□□□ -1.19
RRP40Q08285 ALR1YOL130W 2580 nt7.59□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 FET5YFL041W 1869 nt7.58□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 DUR3YHL016C 2208 nt7.58□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 YJL009WYJL009W 327 nt7.58□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 POP2YNR052C 1302 nt7.57□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 snR86snR86 1004 nt7.57□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 YMR210WYMR210W 1350 nt7.57□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.56□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 EMC3YKL207W 762 nt7.56□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.55□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.55□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.55□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 YER156CYER156C 1017 nt7.54□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 DUS3YLR401C 2007 nt7.54□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 TRP2YER090W 1524 nt7.53□□□□□ -1.2
RRP40Q08285 YLR072WYLR072W 2082 nt7.52□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 RHO1YPR165W 630 nt7.52□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 MEP1YGR121C 1479 nt7.51□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 BXI1YNL305C 894 nt7.51□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 GCD11YER025W 1584 nt7.5□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 HXT11YOL156W 1704 nt7.5□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 RPS6AYPL090C 711 nt7.5□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 RPS6BYBR181C 711 nt7.5□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 GRH1YDR517W 1119 nt7.49□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 UTR5YEL035C 501 nt7.49□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 PUP3YER094C 618 nt7.49□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 MFT1YML062C 1179 nt7.49□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 PAU21YOR394W 495 nt7.48□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 PAU22YPL282C 495 nt7.48□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 ADA2YDR448W 1305 nt7.48□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 SHC1YER096W 1539 nt7.47□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 YPR084WYPR084W 1371 nt7.47□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 YPT31YER031C 672 nt7.47□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 ORT1YOR130C 879 nt7.47□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 MCM5YLR274W 2328 nt7.47□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 THI73YLR004C 1572 nt7.46□□□□□ -1.21
RRP40Q08285 LRO1YNR008W 1986 nt7.46□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 EHT1YBR177C 1356 nt7.45□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 ATP2YJR121W 1536 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 MRP1YDR347W 966 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 YMR206WYMR206W 942 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 HIS3YOR202W 663 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 snR4snR4 186 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 MET30YIL046W 1923 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 ADE2YOR128C 1716 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 ADE16YLR028C 1776 nt7.43□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 BUD20YLR074C 501 nt7.43□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 RCF1YML030W 480 nt7.43□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 YOR343CYOR343C 327 nt7.43□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 SRM1YGL097W 1449 nt7.43□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 YIL177CYIL177C 5277 nt7.43□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 BUD31YCR063W 474 nt7.42□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 HRA1HRA1 564 nt7.42□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 YNL190WYNL190W 615 nt7.42□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 GDH1YOR375C 1365 nt7.42□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 ELP4YPL101W 1371 nt7.42□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 ABP1YCR088W 1779 nt7.41□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 TAD2YJL035C 753 nt7.41□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 LEA1YPL213W 717 nt7.41□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 HXT8YJL214W 1710 nt7.41□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 TIM50YPL063W 1431 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP40Q08285 DIP5YPL265W 1827 nt7.4□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 ECM10YEL030W 1935 nt7.4□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 SNU66YOR308C 1764 nt7.39□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 INO1YJL153C 1602 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 JHD1YER051W 1479 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 TDH1YJL052W 999 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 PMU1YKL128C 888 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 PRE10YOR362C 867 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 NDE2YDL085W 1638 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 PFS2YNL317W 1398 nt7.37□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 MAM3YOL060C 2121 nt7.36□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 YIL168WYIL168W 384 nt7.36□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 LAS17YOR181W 1902 nt7.36□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.35□□□□□ -1.23
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