Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 RPN8YOR261C 1017 nt9.39□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 RPC82YPR190C 1965 nt9.38□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 TVP38YKR088C 1014 nt9.38□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 YMR181CYMR181C 465 nt9.38□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 COG5YNL051W 1212 nt9.38□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 RTC4YNL254C 1206 nt9.38□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 OYE3YPL171C 1203 nt9.38□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 PGC1YPL206C 966 nt9.38□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 ESC2YDR363W 1371 nt9.37□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 YAP6YDR259C 1152 nt9.37□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 APT2YDR441C 546 nt9.37□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 SEC28YIL076W 891 nt9.37□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 SAW1YAL027W 786 nt9.37□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 OAC1YKL120W 975 nt9.37□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 LOT5YKL183W 921 nt9.37□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 YLR118CYLR118C 684 nt9.37□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 YFR045WYFR045W 930 nt9.36□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 PRY1YJL079C 900 nt9.36□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 ARG3YJL088W 1017 nt9.36□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 POP5YAL033W 522 nt9.36□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 CDA2YLR308W 939 nt9.36□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 GFD1YMR255W 567 nt9.36□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 INA1YLR413W 2028 nt9.36□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 YDR220CYDR220C 294 nt9.35□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 AIM2YAL049C 741 nt9.35□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt9.35□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 RPN9YDR427W 1182 nt9.34□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 MED2YDL005C 1296 nt9.33□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 COS6YGR295C 1146 nt9.33□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 PET8YNL003C 855 nt9.33□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 SSN3YPL042C 1668 nt9.32□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 NPL6YMR091C 1308 nt9.32□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 snR56snR56 88 nt9.32□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YER138W-AYER138W-A 105 nt9.32□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 ADD66YKL206C 804 nt9.32□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt9.32□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 DCI1YOR180C 816 nt9.32□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 CSM1YCR086W 573 nt9.31□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 GCV1YDR019C 1203 nt9.31□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.31□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 ATP12YJL180C 978 nt9.31□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 BNI5YNL166C 1347 nt9.31□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 RRT6YGL146C 936 nt9.3□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 OKP1YGR179C 1221 nt9.3□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YLR202CYLR202C 327 nt9.3□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YLR407WYLR407W 687 nt9.3□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YOL079WYOL079W 399 nt9.3□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 BAG7YOR134W 1230 nt9.3□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 SET6YPL165C 1122 nt9.3□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 KAR1YNL188W 1302 nt9.3□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 PPH22YDL188C 1134 nt9.29□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 TCA17YEL048C 459 nt9.29□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YJR115WYJR115W 510 nt9.29□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 FLR1YBR008C 1647 nt9.29□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YMR209CYMR209C 1374 nt9.28□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 COG7YGL005C 840 nt9.28□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YET2YMR040W 483 nt9.28□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 YNL171CYNL171C 369 nt9.28□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 COX11YPL132W 903 nt9.28□□□□□ -0.92
BUD20Q08004 CMP2YML057W 1815 nt9.27□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 SPT20YOL148C 1815 nt9.27□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 SAM2YDR502C 1155 nt9.27□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 DDI1YER143W 1287 nt9.27□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 TDH1YJL052W 999 nt9.27□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 PHO23YNL097C 993 nt9.27□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 SEC61YLR378C 1443 nt9.27□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 ATG22YCL038C 1587 nt9.27□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 FMS1YMR020W 1527 nt9.26□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 NMT1YLR195C 1368 nt9.26□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 OXA1YER154W 1209 nt9.26□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 YFL019CYFL019C 354 nt9.26□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 SPC42YKL042W 1092 nt9.26□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 YNL226WYNL226W 411 nt9.26□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 PTC4YBR125C 1182 nt9.26□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 MSC1YML128C 1542 nt9.26□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.25□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 CWC15YDR163W 528 nt9.25□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 YPI1YFR003C 468 nt9.25□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 YNR029CYNR029C 1290 nt9.25□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 TIF5YPR041W 1218 nt9.25□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 RSC8YFR037C 1674 nt9.24□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 YJL055WYJL055W 738 nt9.24□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 SRL2YLR082C 1179 nt9.24□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 IBD2YNL164C 1056 nt9.24□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 ADH1YOL086C 1047 nt9.24□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 YPS3YLR121C 1527 nt9.24□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 HXT12YIL170W 1374 nt9.24□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 RIB2YOL066C 1776 nt9.23□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 YDR161WYDR161W 1164 nt9.23□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 THI80YOR143C 960 nt9.23□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 SPP2YOR148C 558 nt9.23□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 SAS4YDR181C 1446 nt9.22□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 SAM3YPL274W 1764 nt9.22□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 ACH1YBL015W 1581 nt9.22□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 FUB1YCR076C 753 nt9.22□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 YJR096WYJR096W 849 nt9.22□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 CTR3YLR411W 726 nt9.22□□□□□ -0.93
BUD20Q08004 VRG4YGL225W 1014 nt9.21□□□□□ -0.94
BUD20Q08004 YIP3YNL044W 531 nt9.21□□□□□ -0.94
BUD20Q08004 IPI3YNL182C 1668 nt9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.5 ms