Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP1Q07954 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRP1Q07954 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms