Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNK2Q07912 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNK2Q07912 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNK2Q07912 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TNK2Q07912 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms