Protein–RNA interactions for Protein: Q02630

NUP116, Nucleoporin NUP116/NSP116, yeastyeast

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP116Q02630 GAS1YMR307W 1680 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 RPL12BYDR418W 498 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 IGD1YFR017C 588 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 CDD1YLR245C 429 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 AIM34YMR003W 597 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 YJL009WYJL009W 327 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 YKR012CYKR012C 378 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 ABP1YCR088W 1779 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 PTC6YCR079W 1329 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP116Q02630 NDE2YDL085W 1638 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 SDS24YBR214W 1584 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 MFG1YDL233W 1377 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 MAM3YOL060C 2121 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 SAM50YNL026W 1455 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 TMS1YDR105C 1422 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 PMT7YDR307W 1989 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 LYS20YDL182W 1287 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 YPL264CYPL264C 1062 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 CHA1YCL064C 1083 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 PHB2YGR231C 933 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 ADH3YMR083W 1128 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 YOR268CYOR268C 399 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 VBA3YCL069W 1377 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 RSM7YJR113C 744 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 YOR343CYOR343C 327 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 ENO1YGR254W 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 SPE4YLR146C 903 nt7.34□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 YNL140CYNL140C 570 nt7.34□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 LAS17YOR181W 1902 nt7.34□□□□□ -1.23
NUP116Q02630 PRC1YMR297W 1599 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 ITR1YDR497C 1755 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 TIF3YPR163C 1311 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 MOB1YIL106W 945 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 FLX1YIL134W 936 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 ATP10YLR393W 840 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 IPL1YPL209C 1104 nt7.32□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.31□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 YIR035CYIR035C 765 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 CYC3YAL039C 810 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 NME1NME1 340 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 BEM1YBR200W 1656 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 YFR020WYFR020W 699 nt7.29□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 RRT6YGL146C 936 nt7.29□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 HOG1YLR113W 1308 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 INO1YJL153C 1602 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 SRP102YKL154W 735 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 WSC4YHL028W 1818 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 MEP1YGR121C 1479 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP116Q02630 ECM10YEL030W 1935 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 SWM1YDR260C 513 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 INM1YHR046C 888 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 YJR149WYJR149W 1215 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.26□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 YBR056WYBR056W 1506 nt7.26□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 YER152CYER152C 1332 nt7.26□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 HXT9YJL219W 1704 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 YCR025CYCR025C 411 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 YLR460CYLR460C 1131 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 PAU21YOR394W 495 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 PAU22YPL282C 495 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 YEL023CYEL023C 2049 nt7.25□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 TGL5YOR081C 2250 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 BUD31YCR063W 474 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 GGC1YDL198C 903 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 GLY1YEL046C 1164 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 YLR280CYLR280C 351 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 BUB2YMR055C 921 nt7.24□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 TOP3YLR234W 1971 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 YMR007WYMR007W 381 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 YMR253CYMR253C 1245 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 RCR1YBR005W 642 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 ERR3YMR323W 1314 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 ERR1YOR393W 1314 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 ERR2YPL281C 1314 nt7.23□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 MRN1YPL184C 1839 nt7.22□□□□□ -1.25
NUP116Q02630 STF1YDL130W-A 261 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 CHS7YHR142W 951 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 HRA1HRA1 564 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 MET13YGL125W 1803 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 ERO1YML130C 1692 nt7.21□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 SGF73YGL066W 1974 nt7.19□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 SER2YGR208W 930 nt7.19□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 TDA4YJR116W 840 nt7.19□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 YJL045WYJL045W 1905 nt7.19□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 KTR4YBR199W 1395 nt7.19□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 OLA1YBR025C 1185 nt7.18□□□□□ -1.26
NUP116Q02630 HTS1YPR033C 1641 nt7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.9 ms