Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPS35P82673 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPS35P82673 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MRPS35P82673 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms