Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS3AP61247 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS3AP61247 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS3AP61247 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS3AP61247 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS3AP61247 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms