Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA1P56199 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA1P56199 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA1P56199 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms