Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRLP54845 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRLP54845 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NRLP54845 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRLP54845 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRLP54845 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRLP54845 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRLP54845 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRLP54845 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRLP54845 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRLP54845 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRLP54845 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRLP54845 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRLP54845 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRLP54845 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRLP54845 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRLP54845 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRLP54845 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRLP54845 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRLP54845 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRLP54845 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRLP54845 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRLP54845 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRLP54845 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRLP54845 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRLP54845 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRLP54845 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRLP54845 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRLP54845 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRLP54845 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NRLP54845 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRLP54845 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRLP54845 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRLP54845 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRLP54845 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRLP54845 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRLP54845 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRLP54845 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRLP54845 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRLP54845 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRLP54845 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRLP54845 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRLP54845 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NRLP54845 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRLP54845 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRLP54845 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NRLP54845 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRLP54845 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRLP54845 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NRLP54845 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRLP54845 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRLP54845 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRLP54845 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NRLP54845 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRLP54845 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRLP54845 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRLP54845 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRLP54845 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRLP54845 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NRLP54845 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRLP54845 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRLP54845 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRLP54845 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRLP54845 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NRLP54845 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NRLP54845 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NRLP54845 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NRLP54845 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRLP54845 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRLP54845 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NRLP54845 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NRLP54845 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NRLP54845 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NRLP54845 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NRLP54845 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NRLP54845 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRLP54845 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms