Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN1P54253 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN1P54253 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN1P54253 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATXN1P54253 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN1P54253 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms