Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 DIP5YPL265W 1827 nt7.4□□□□□ -1.23
SYF2P53277 LRO1YNR008W 1986 nt7.4□□□□□ -1.23
SYF2P53277 PDC6YGR087C 1692 nt7.39□□□□□ -1.23
SYF2P53277 POP2YNR052C 1302 nt7.39□□□□□ -1.23
SYF2P53277 YCR025CYCR025C 411 nt7.39□□□□□ -1.23
SYF2P53277 ADE16YLR028C 1776 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF2P53277 BUD31YCR063W 474 nt7.38□□□□□ -1.23
SYF2P53277 OCH1YGL038C 1443 nt7.36□□□□□ -1.23
SYF2P53277 MRN1YPL184C 1839 nt7.36□□□□□ -1.23
SYF2P53277 EHT1YBR177C 1356 nt7.36□□□□□ -1.23
SYF2P53277 SWM1YDR260C 513 nt7.36□□□□□ -1.23
SYF2P53277 PUP1YOR157C 786 nt7.36□□□□□ -1.23
SYF2P53277 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF2P53277 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF2P53277 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF2P53277 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF2P53277 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF2P53277 YGR210CYGR210C 1236 nt7.35□□□□□ -1.23
SYF2P53277 HTS1YPR033C 1641 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF2P53277 DIA4YHR011W 1341 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF2P53277 SHC1YER096W 1539 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF2P53277 CHS7YHR142W 951 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF2P53277 NAP1YKR048C 1254 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF2P53277 YLR460CYLR460C 1131 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF2P53277 YMR166CYMR166C 1107 nt7.34□□□□□ -1.23
SYF2P53277 WSC4YHL028W 1818 nt7.34□□□□□ -1.24
SYF2P53277 GLY1YEL046C 1164 nt7.33□□□□□ -1.24
SYF2P53277 YPL108WYPL108W 507 nt7.33□□□□□ -1.24
SYF2P53277 INO1YJL153C 1602 nt7.32□□□□□ -1.24
SYF2P53277 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.32□□□□□ -1.24
SYF2P53277 CAK1YFL029C 1107 nt7.32□□□□□ -1.24
SYF2P53277 RSC4YKR008W 1878 nt7.32□□□□□ -1.24
SYF2P53277 PET18YCR020C 648 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF2P53277 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF2P53277 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF2P53277 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF2P53277 MAS1YLR163C 1389 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF2P53277 HXT8YJL214W 1710 nt7.3□□□□□ -1.24
SYF2P53277 TIF3YPR163C 1311 nt7.29□□□□□ -1.24
SYF2P53277 ALG7YBR243C 1347 nt7.29□□□□□ -1.24
SYF2P53277 RHO1YPR165W 630 nt7.29□□□□□ -1.24
SYF2P53277 PFS2YNL317W 1398 nt7.29□□□□□ -1.24
SYF2P53277 NDE2YDL085W 1638 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF2P53277 TGL5YOR081C 2250 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF2P53277 ARO3YDR035W 1113 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF2P53277 PUP3YER094C 618 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF2P53277 SLG1YOR008C 1137 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF2P53277 OLA1YBR025C 1185 nt7.28□□□□□ -1.24
SYF2P53277 MET30YIL046W 1923 nt7.27□□□□□ -1.25
SYF2P53277 TDA4YJR116W 840 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF2P53277 RCF1YML030W 480 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF2P53277 YNL140CYNL140C 570 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF2P53277 LSP1YPL004C 1026 nt7.26□□□□□ -1.25
SYF2P53277 PMT1YDL095W 2454 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF2P53277 INM1YHR046C 888 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF2P53277 YJL160CYJL160C 864 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF2P53277 HSV2YGR223C 1347 nt7.25□□□□□ -1.25
SYF2P53277 YIL177CYIL177C 5277 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF2P53277 SAM50YNL026W 1455 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF2P53277 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF2P53277 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF2P53277 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF2P53277 RRT14YIL127C 621 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF2P53277 MET13YGL125W 1803 nt7.24□□□□□ -1.25
SYF2P53277 PMT7YDR307W 1989 nt7.23□□□□□ -1.25
SYF2P53277 YCP4YCR004C 744 nt7.23□□□□□ -1.25
SYF2P53277 YNL190WYNL190W 615 nt7.23□□□□□ -1.25
SYF2P53277 WSC3YOL105C 1671 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF2P53277 THI73YLR004C 1572 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF2P53277 YER156CYER156C 1017 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF2P53277 BXI1YNL305C 894 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF2P53277 MDH2YOL126C 1134 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF2P53277 FCY1YPR062W 477 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF2P53277 TPO1YLL028W 1761 nt7.21□□□□□ -1.25
SYF2P53277 ELP6YMR312W 822 nt7.21□□□□□ -1.26
SYF2P53277 SLM3YDL033C 1254 nt7.2□□□□□ -1.26
SYF2P53277 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.2□□□□□ -1.26
SYF2P53277 TIM50YPL063W 1431 nt7.19□□□□□ -1.26
SYF2P53277 MRP7YNL005C 1116 nt7.19□□□□□ -1.26
SYF2P53277 RPS6AYPL090C 711 nt7.19□□□□□ -1.26
SYF2P53277 RPS6BYBR181C 711 nt7.19□□□□□ -1.26
SYF2P53277 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.18□□□□□ -1.26
SYF2P53277 KTR4YBR199W 1395 nt7.18□□□□□ -1.26
SYF2P53277 JHD1YER051W 1479 nt7.17□□□□□ -1.26
SYF2P53277 FRA1YLL029W 2250 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF2P53277 AIM34YMR003W 597 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF2P53277 TOM71YHR117W 1920 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF2P53277 UTR5YEL035C 501 nt7.15□□□□□ -1.26
SYF2P53277 ATP2YJR121W 1536 nt7.15□□□□□ -1.27
SYF2P53277 MTC6YHR151C 1581 nt7.14□□□□□ -1.27
SYF2P53277 SNP1YIL061C 903 nt7.14□□□□□ -1.27
SYF2P53277 LAS17YOR181W 1902 nt7.14□□□□□ -1.27
SYF2P53277 PDC5YLR134W 1692 nt7.13□□□□□ -1.27
SYF2P53277 YMR007WYMR007W 381 nt7.13□□□□□ -1.27
SYF2P53277 YPT31YER031C 672 nt7.12□□□□□ -1.27
SYF2P53277 PRE10YOR362C 867 nt7.12□□□□□ -1.27
SYF2P53277 GNP1YDR508C 1992 nt7.1□□□□□ -1.27
SYF2P53277 SGF73YGL066W 1974 nt7.1□□□□□ -1.27
SYF2P53277 ALR1YOL130W 2580 nt7.1□□□□□ -1.27
SYF2P53277 CHA1YCL064C 1083 nt7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.3 ms