Protein–RNA interactions for Protein: P53153

LCL3, Probable endonuclease LCL3, yeastyeast

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCL3P53153 PET18YCR020C 648 nt7.45□□□□□ -1.22
LCL3P53153 MRP1YDR347W 966 nt7.45□□□□□ -1.22
LCL3P53153 MDM35YKL053C-A 261 nt7.44□□□□□ -1.22
LCL3P53153 YLR460CYLR460C 1131 nt7.44□□□□□ -1.22
LCL3P53153 MGM101YJR144W 810 nt7.43□□□□□ -1.22
LCL3P53153 YRF1-2YER190W 5046 nt7.41□□□□□ -1.22
LCL3P53153 CAK1YFL029C 1107 nt7.41□□□□□ -1.22
LCL3P53153 MFT1YML062C 1179 nt7.41□□□□□ -1.22
LCL3P53153 YMR209CYMR209C 1374 nt7.41□□□□□ -1.22
LCL3P53153 UTR5YEL035C 501 nt7.4□□□□□ -1.22
LCL3P53153 RRT14YIL127C 621 nt7.4□□□□□ -1.22
LCL3P53153 GGA2YHR108W 1758 nt7.39□□□□□ -1.23
LCL3P53153 GDH1YOR375C 1365 nt7.39□□□□□ -1.23
LCL3P53153 YDR467CYDR467C 327 nt7.39□□□□□ -1.23
LCL3P53153 CHS7YHR142W 951 nt7.39□□□□□ -1.23
LCL3P53153 DPL1YDR294C 1770 nt7.38□□□□□ -1.23
LCL3P53153 DMA2YNL116W 1569 nt7.38□□□□□ -1.23
LCL3P53153 OCH1YGL038C 1443 nt7.38□□□□□ -1.23
LCL3P53153 ADA2YDR448W 1305 nt7.38□□□□□ -1.23
LCL3P53153 INH1YDL181W 258 nt7.38□□□□□ -1.23
LCL3P53153 KAE1YKR038C 1161 nt7.38□□□□□ -1.23
LCL3P53153 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 CYT1YOR065W 930 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 OLA1YBR025C 1185 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 YOR268CYOR268C 399 nt7.37□□□□□ -1.23
LCL3P53153 YJR149WYJR149W 1215 nt7.36□□□□□ -1.23
LCL3P53153 GPM1YKL152C 744 nt7.36□□□□□ -1.23
LCL3P53153 MET22YOL064C 1074 nt7.36□□□□□ -1.23
LCL3P53153 LPD1YFL018C 1500 nt7.36□□□□□ -1.23
LCL3P53153 RPS6AYPL090C 711 nt7.35□□□□□ -1.23
LCL3P53153 RPS6BYBR181C 711 nt7.35□□□□□ -1.23
LCL3P53153 LEU4YNL104C 1860 nt7.34□□□□□ -1.23
LCL3P53153 YPR084WYPR084W 1371 nt7.34□□□□□ -1.23
LCL3P53153 TAD2YJL035C 753 nt7.34□□□□□ -1.23
LCL3P53153 YER156CYER156C 1017 nt7.33□□□□□ -1.24
LCL3P53153 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.33□□□□□ -1.24
LCL3P53153 YMC2YBR104W 990 nt7.33□□□□□ -1.24
LCL3P53153 THI3YDL080C 1830 nt7.33□□□□□ -1.24
LCL3P53153 ELP4YPL101W 1371 nt7.33□□□□□ -1.24
LCL3P53153 TOS1YBR162C 1368 nt7.33□□□□□ -1.24
LCL3P53153 YMR206WYMR206W 942 nt7.32□□□□□ -1.24
LCL3P53153 BXI1YNL305C 894 nt7.32□□□□□ -1.24
LCL3P53153 YPT31YER031C 672 nt7.3□□□□□ -1.24
LCL3P53153 EDC2YER035W 438 nt7.3□□□□□ -1.24
LCL3P53153 COG1YGL223C 1254 nt7.3□□□□□ -1.24
LCL3P53153 YIR035CYIR035C 765 nt7.3□□□□□ -1.24
LCL3P53153 YBL095WYBL095W 813 nt7.3□□□□□ -1.24
LCL3P53153 PDC6YGR087C 1692 nt7.3□□□□□ -1.24
LCL3P53153 PSD1YNL169C 1503 nt7.29□□□□□ -1.24
LCL3P53153 RNA170RNA170 169 nt7.28□□□□□ -1.24
LCL3P53153 HDA1YNL021W 2121 nt7.27□□□□□ -1.25
LCL3P53153 TDH1YJL052W 999 nt7.27□□□□□ -1.25
LCL3P53153 MRS4YKR052C 915 nt7.27□□□□□ -1.25
LCL3P53153 MFG1YDL233W 1377 nt7.27□□□□□ -1.25
LCL3P53153 SMC5YOL034W 3282 nt7.27□□□□□ -1.25
LCL3P53153 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.26□□□□□ -1.25
LCL3P53153 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.26□□□□□ -1.25
LCL3P53153 FAF1YIL019W 1041 nt7.26□□□□□ -1.25
LCL3P53153 YJL043WYJL043W 774 nt7.26□□□□□ -1.25
LCL3P53153 ADE1YAR015W 921 nt7.26□□□□□ -1.25
LCL3P53153 RHO1YPR165W 630 nt7.26□□□□□ -1.25
LCL3P53153 UBP13YBL067C 2244 nt7.25□□□□□ -1.25
LCL3P53153 YJL009WYJL009W 327 nt7.25□□□□□ -1.25
LCL3P53153 CMK2YOL016C 1344 nt7.25□□□□□ -1.25
LCL3P53153 TMS1YDR105C 1422 nt7.24□□□□□ -1.25
LCL3P53153 THI73YLR004C 1572 nt7.24□□□□□ -1.25
LCL3P53153 ATP2YJR121W 1536 nt7.23□□□□□ -1.25
LCL3P53153 NDE1YMR145C 1683 nt7.23□□□□□ -1.25
LCL3P53153 CRN1YLR429W 1956 nt7.23□□□□□ -1.25
LCL3P53153 YIL168WYIL168W 384 nt7.23□□□□□ -1.25
LCL3P53153 BUB2YMR055C 921 nt7.23□□□□□ -1.25
LCL3P53153 YOR072WYOR072W 315 nt7.23□□□□□ -1.25
LCL3P53153 PET494YNR045W 1470 nt7.23□□□□□ -1.25
LCL3P53153 AGP3YFL055W 1677 nt7.22□□□□□ -1.25
LCL3P53153 DAL7YIR031C 1665 nt7.22□□□□□ -1.25
LCL3P53153 NPP2YEL016C 1482 nt7.22□□□□□ -1.25
LCL3P53153 ATG22YCL038C 1587 nt7.21□□□□□ -1.25
LCL3P53153 CCR4YAL021C 2514 nt7.21□□□□□ -1.26
LCL3P53153 FUS3YBL016W 1062 nt7.21□□□□□ -1.26
LCL3P53153 IDP3YNL009W 1263 nt7.21□□□□□ -1.26
LCL3P53153 YHR218WYHR218W 1812 nt7.21□□□□□ -1.26
LCL3P53153 BAP3YDR046C 1815 nt7.2□□□□□ -1.26
LCL3P53153 NUP53YMR153W 1428 nt7.2□□□□□ -1.26
LCL3P53153 PRE5YMR314W 705 nt7.2□□□□□ -1.26
LCL3P53153 SDH8YBR269C 417 nt7.2□□□□□ -1.26
LCL3P53153 HOG1YLR113W 1308 nt7.19□□□□□ -1.26
LCL3P53153 AAT1YKL106W 1356 nt7.19□□□□□ -1.26
LCL3P53153 BIM1YER016W 1035 nt7.18□□□□□ -1.26
LCL3P53153 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.18□□□□□ -1.26
LCL3P53153 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.18□□□□□ -1.26
LCL3P53153 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.18□□□□□ -1.26
LCL3P53153 PUP3YER094C 618 nt7.17□□□□□ -1.26
LCL3P53153 SHC1YER096W 1539 nt7.17□□□□□ -1.26
LCL3P53153 YKR023WYKR023W 1593 nt7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.9 ms