Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.85e-8■■■■■ 39.8
HNRNPMP52272 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 225.74■■□□□ 1.715e-8■■■■■ 39.8
HNRNPMP52272 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.055e-8■■■■■ 39.8
HNRNPMP52272 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 39.8
HNRNPMP52272 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 39.8
HNRNPMP52272 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 39.8
HNRNPMP52272 PTK2-237ENST00000521985 538 ntTSL 317.75■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 39.7
HNRNPMP52272 EHMT1-202ENST00000460486 818 ntTSL 526.89■■□□□ 1.91e-6■■■■■ 39.7
HNRNPMP52272 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.124e-7■■■■■ 39.6
HNRNPMP52272 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 530.4■■■□□ 2.461e-6■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 PELP1-213ENST00000575101 442 ntTSL 330.25■■■□□ 2.433e-7■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 PELP1-204ENST00000570571 902 ntTSL 326■■□□□ 1.753e-7■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 220.66■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 218.33■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 39.5
HNRNPMP52272 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 524.8■■□□□ 1.568e-7■■■■■ 39.4
HNRNPMP52272 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.868e-7■■■■■ 39.4
HNRNPMP52272 DLGAP4-AS1-204ENST00000559455 584 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 39.4
HNRNPMP52272 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 428.59■■■□□ 2.179e-9■■■■■ 39.4
HNRNPMP52272 SUN1-209ENST00000424128 633 ntTSL 528.25■■■□□ 2.118e-7■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SUN1-216ENST00000440380 537 ntTSL 527.99■■■□□ 2.078e-7■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SUN1-211ENST00000427969 520 ntTSL 422.56■■□□□ 1.28e-7■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SUN1-215ENST00000439679 626 ntTSL 521.78■■□□□ 1.088e-7■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.486e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SLC39A11-209ENST00000580557 794 ntTSL 322.28■■□□□ 1.166e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.926e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SLC39A11-213ENST00000582769 567 ntTSL 520.56■□□□□ 0.886e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SLC39A11-206ENST00000579491 692 ntTSL 320.56■□□□□ 0.886e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.686e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SLC39A11-217ENST00000584129 747 ntTSL 316.27■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SLC39A11-214ENST00000583146 532 ntTSL 514.69□□□□□ -0.066e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.354e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 322.87■■□□□ 1.254e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.164e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.014e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 518.64■□□□□ 0.574e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 514.73□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.134e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 FOXJ3-207ENST00000445886 1326 ntTSL 1 (best)36.59■■■■□ 3.451e-6■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 39.3
HNRNPMP52272 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 232.71■■■□□ 2.838e-8■■■■■ 39.2
HNRNPMP52272 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.447e-7■■■■■ 39.2
HNRNPMP52272 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 515.61■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 39.2
HNRNPMP52272 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 225.1■■□□□ 1.614e-7■■■■■ 39.2
HNRNPMP52272 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 315.16■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 39.2
HNRNPMP52272 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.717e-7■■■■■ 39.2
HNRNPMP52272 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.82e-16■■■■■ 39.1
HNRNPMP52272 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 56.61□□□□□ -1.356e-7■■■■■ 39.1
HNRNPMP52272 CLK3-209ENST00000562670 544 ntTSL 420.81■□□□□ 0.924e-10■■■■■ 39.1
HNRNPMP52272 CLK3-214ENST00000564096 805 ntTSL 219.23■□□□□ 0.674e-10■■■■■ 39.1
HNRNPMP52272 CLK3-226ENST00000569406 3591 ntTSL 214.24□□□□□ -0.134e-10■■■■■ 39.1
HNRNPMP52272 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 39
HNRNPMP52272 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 39
HNRNPMP52272 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 39
HNRNPMP52272 SEPT10-205ENST00000415095 1605 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 39
HNRNPMP52272 SEPT10-203ENST00000397714 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 39
HNRNPMP52272 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 320.18■□□□□ 0.821e-11■■■■■ 39
HNRNPMP52272 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.251e-11■■■■■ 39
HNRNPMP52272 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.586e-8■■■■■ 39
HNRNPMP52272 MTX2-205ENST00000452865 817 ntTSL 337.44■■■■□ 3.586e-8■■■■■ 39
HNRNPMP52272 MTX2-203ENST00000423461 618 ntTSL 336.93■■■■□ 3.56e-8■■■■■ 39
HNRNPMP52272 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.046e-8■■■■■ 39
HNRNPMP52272 MTX2-202ENST00000420864 1592 ntTSL 1 (best)33.36■■■□□ 2.936e-8■■■■■ 39
HNRNPMP52272 PAPSS1-203ENST00000504987 492 ntTSL 429.36■■■□□ 2.294e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 PAPSS1-206ENST00000512641 466 ntTSL 429.09■■■□□ 2.254e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 SEPSECS-206ENST00000514585 1494 ntTSL 1 (best)29.05■■■□□ 2.244e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.034e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 PAPSS1-207ENST00000514489 579 ntTSL 420.8■□□□□ 0.924e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.814e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.264e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 RGS3-219ENST00000478599 4211 ntTSL 216.63■□□□□ 0.254e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.194e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 SEPSECS-201ENST00000358971 3344 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.284e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 SEPSECS-202ENST00000382103 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.374e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 SEPSECS-203ENST00000503150 544 ntTSL 48.17□□□□□ -1.14e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 SEPSECS-204ENST00000505513 420 ntTSL 36.06□□□□□ -1.444e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 AKT1-216ENST00000556836 592 ntTSL 431.67■■■□□ 2.665e-10■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 MAN1B1-209ENST00000536349 5048 ntTSL 218.22■□□□□ 0.514e-9■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 522.17■■□□□ 1.143e-7■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 521.55■■□□□ 1.043e-7■■■■■ 38.9
HNRNPMP52272 PEX14-202ENST00000472851 805 ntTSL 328.95■■■□□ 2.221e-6■■■■■ 38.8
HNRNPMP52272 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.881e-6■■■■■ 38.8
HNRNPMP52272 PEX14-203ENST00000491661 637 ntTSL 215.15■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 38.8
HNRNPMP52272 MGAT4A-207ENST00000484936 768 ntTSL 55.6□□□□□ -1.519e-7■■■■■ 38.7
HNRNPMP52272 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.033e-8■■■■■ 38.7
HNRNPMP52272 QRICH2-203ENST00000524722 2253 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 38.7
HNRNPMP52272 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 38.7
HNRNPMP52272 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 38.6
HNRNPMP52272 CELF1-206ENST00000422993 553 ntTSL 56.66□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 38.6
HNRNPMP52272 ANKRD12-206ENST00000577992 390 ntTSL 335.72■■■■□ 3.311e-7■■■■■ 38.5
HNRNPMP52272 ANKRD12-209ENST00000585234 313 ntTSL 323.53■■□□□ 1.361e-7■■■■■ 38.5
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 355.9 ms