Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RORCP51449 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RORCP51449 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RORCP51449 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RORCP51449 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RORCP51449 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORCP51449 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORCP51449 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORCP51449 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORCP51449 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORCP51449 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORCP51449 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORCP51449 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RORCP51449 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORCP51449 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORCP51449 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RORCP51449 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORCP51449 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RORCP51449 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORCP51449 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORCP51449 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RORCP51449 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORCP51449 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORCP51449 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RORCP51449 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RORCP51449 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RORCP51449 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RORCP51449 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RORCP51449 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORCP51449 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORCP51449 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORCP51449 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORCP51449 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORCP51449 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORCP51449 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORCP51449 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORCP51449 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORCP51449 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORCP51449 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORCP51449 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RORCP51449 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORCP51449 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORCP51449 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORCP51449 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORCP51449 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORCP51449 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORCP51449 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORCP51449 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RORCP51449 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORCP51449 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORCP51449 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORCP51449 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORCP51449 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RORCP51449 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORCP51449 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORCP51449 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORCP51449 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORCP51449 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORCP51449 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORCP51449 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORCP51449 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORCP51449 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORCP51449 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RORCP51449 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORCP51449 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORCP51449 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORCP51449 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORCP51449 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORCP51449 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORCP51449 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORCP51449 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORCP51449 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORCP51449 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORCP51449 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RORCP51449 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORCP51449 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORCP51449 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORCP51449 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORCP51449 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RORCP51449 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RORCP51449 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORCP51449 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORCP51449 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORCP51449 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORCP51449 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RORCP51449 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RORCP51449 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RORCP51449 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RORCP51449 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RORCP51449 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms