Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB2P49721 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB2P49721 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMB2P49721 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMB2P49721 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms