Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPAP49450 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPAP49450 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPAP49450 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPAP49450 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPAP49450 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPAP49450 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPAP49450 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPAP49450 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPAP49450 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPAP49450 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPAP49450 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPAP49450 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPAP49450 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPAP49450 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPAP49450 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPAP49450 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPAP49450 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPAP49450 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPAP49450 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPAP49450 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPAP49450 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPAP49450 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPAP49450 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPAP49450 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPAP49450 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPAP49450 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPAP49450 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPAP49450 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPAP49450 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPAP49450 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPAP49450 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPAP49450 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPAP49450 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPAP49450 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPAP49450 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPAP49450 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPAP49450 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPAP49450 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPAP49450 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPAP49450 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPAP49450 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPAP49450 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPAP49450 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPAP49450 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPAP49450 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPAP49450 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPAP49450 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPAP49450 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPAP49450 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPAP49450 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPAP49450 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPAP49450 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPAP49450 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPAP49450 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPAP49450 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPAP49450 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPAP49450 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPAP49450 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPAP49450 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPAP49450 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPAP49450 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPAP49450 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPAP49450 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPAP49450 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPAP49450 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPAP49450 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPAP49450 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPAP49450 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPAP49450 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPAP49450 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPAP49450 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPAP49450 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPAP49450 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPAP49450 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPAP49450 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPAP49450 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPAP49450 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPAP49450 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPAP49450 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPAP49450 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPAP49450 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPAP49450 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPAP49450 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPAP49450 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPAP49450 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPAP49450 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPAP49450 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPAP49450 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPAP49450 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPAP49450 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPAP49450 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPAP49450 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPAP49450 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPAP49450 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPAP49450 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPAP49450 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPAP49450 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPAP49450 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPAP49450 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms