Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTTP42858 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HTTP42858 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HTTP42858 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HTTP42858 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HTTP42858 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HTTP42858 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HTTP42858 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTTP42858 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTTP42858 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTTP42858 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HTTP42858 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HTTP42858 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HTTP42858 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HTTP42858 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HTTP42858 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTTP42858 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HTTP42858 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HTTP42858 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HTTP42858 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTTP42858 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTTP42858 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTTP42858 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTTP42858 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HTTP42858 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTTP42858 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTTP42858 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTTP42858 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTTP42858 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTTP42858 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTTP42858 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTTP42858 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HTTP42858 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTTP42858 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTTP42858 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HTTP42858 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HTTP42858 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HTTP42858 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HTTP42858 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HTTP42858 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTTP42858 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTTP42858 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTTP42858 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTTP42858 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTTP42858 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTTP42858 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HTTP42858 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HTTP42858 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTTP42858 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTTP42858 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTTP42858 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTTP42858 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTTP42858 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTTP42858 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTTP42858 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTTP42858 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HTTP42858 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HTTP42858 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HTTP42858 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HTTP42858 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HTTP42858 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HTTP42858 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HTTP42858 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HTTP42858 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
HTTP42858 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HTTP42858 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTTP42858 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTTP42858 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTTP42858 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTTP42858 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTTP42858 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HTTP42858 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HTTP42858 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HTTP42858 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HTTP42858 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HTTP42858 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTTP42858 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTTP42858 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTTP42858 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HTTP42858 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTTP42858 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTTP42858 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTTP42858 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTTP42858 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTTP42858 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTTP42858 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTTP42858 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTTP42858 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTTP42858 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTTP42858 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTTP42858 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTTP42858 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HTTP42858 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HTTP42858 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTTP42858 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTTP42858 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTTP42858 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTTP42858 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTTP42858 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTTP42858 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms