Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL35P42766 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL35P42766 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL35P42766 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL35P42766 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL35P42766 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL35P42766 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL35P42766 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL35P42766 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL35P42766 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL35P42766 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL35P42766 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL35P42766 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL35P42766 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL35P42766 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL35P42766 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL35P42766 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL35P42766 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL35P42766 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL35P42766 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL35P42766 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL35P42766 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL35P42766 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL35P42766 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL35P42766 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL35P42766 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL35P42766 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL35P42766 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL35P42766 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL35P42766 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL35P42766 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL35P42766 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL35P42766 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL35P42766 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL35P42766 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL35P42766 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL35P42766 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL35P42766 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL35P42766 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL35P42766 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL35P42766 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL35P42766 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL35P42766 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL35P42766 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL35P42766 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL35P42766 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL35P42766 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL35P42766 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL35P42766 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL35P42766 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL35P42766 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL35P42766 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL35P42766 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL35P42766 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL35P42766 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL35P42766 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL35P42766 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL35P42766 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL35P42766 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL35P42766 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL35P42766 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL35P42766 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL35P42766 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL35P42766 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL35P42766 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL35P42766 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL35P42766 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL35P42766 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL35P42766 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL35P42766 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL35P42766 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL35P42766 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL35P42766 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL35P42766 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL35P42766 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL35P42766 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL35P42766 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL35P42766 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL35P42766 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL35P42766 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL35P42766 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL35P42766 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL35P42766 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL35P42766 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL35P42766 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL35P42766 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL35P42766 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL35P42766 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL35P42766 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL35P42766 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL35P42766 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL35P42766 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL35P42766 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL35P42766 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL35P42766 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL35P42766 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL35P42766 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL35P42766 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL35P42766 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL35P42766 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms