Protein–RNA interactions for Protein: P38873

KOG1, Target of rapamycin complex 1 subunit KOG1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KOG1P38873 RHO1YPR165W 630 nt13.71□□□□□ -0.22
KOG1P38873 TRR2YHR106W 1029 nt13.7□□□□□ -0.22
KOG1P38873 YMR265CYMR265C 1386 nt13.69□□□□□ -0.22
KOG1P38873 IRC7YFR055W 1023 nt13.69□□□□□ -0.22
KOG1P38873 MBF1YOR298C-A 456 nt13.67□□□□□ -0.22
KOG1P38873 ITR2YOL103W 1830 nt13.65□□□□□ -0.22
KOG1P38873 BIO5YNR056C 1686 nt13.64□□□□□ -0.23
KOG1P38873 SHC1YER096W 1539 nt13.62□□□□□ -0.23
KOG1P38873 MDH1YKL085W 1005 nt13.62□□□□□ -0.23
KOG1P38873 RNA170RNA170 169 nt13.6□□□□□ -0.23
KOG1P38873 RPN14YGL004C 1254 nt13.59□□□□□ -0.23
KOG1P38873 YER152CYER152C 1332 nt13.59□□□□□ -0.23
KOG1P38873 YKL147CYKL147C 618 nt13.58□□□□□ -0.23
KOG1P38873 YOR200WYOR200W 399 nt13.58□□□□□ -0.23
KOG1P38873 DCR2YLR361C 1737 nt13.58□□□□□ -0.24
KOG1P38873 THI73YLR004C 1572 nt13.57□□□□□ -0.24
KOG1P38873 PRS4YBL068W 981 nt13.57□□□□□ -0.24
KOG1P38873 YHR219WYHR219W 1875 nt13.56□□□□□ -0.24
KOG1P38873 CKI1YLR133W 1749 nt13.55□□□□□ -0.24
KOG1P38873 ADH6YMR318C 1083 nt13.54□□□□□ -0.24
KOG1P38873 YPL067CYPL067C 597 nt13.53□□□□□ -0.24
KOG1P38873 SCS22YBL091C-A 528 nt13.52□□□□□ -0.25
KOG1P38873 GPD2YOL059W 1323 nt13.51□□□□□ -0.25
KOG1P38873 CRN1YLR429W 1956 nt13.5□□□□□ -0.25
KOG1P38873 JHD1YER051W 1479 nt13.48□□□□□ -0.25
KOG1P38873 ARO3YDR035W 1113 nt13.47□□□□□ -0.25
KOG1P38873 PUP3YER094C 618 nt13.47□□□□□ -0.25
KOG1P38873 DLD3YEL071W 1491 nt13.46□□□□□ -0.25
KOG1P38873 PMU1YKL128C 888 nt13.46□□□□□ -0.25
KOG1P38873 MEP1YGR121C 1479 nt13.42□□□□□ -0.26
KOG1P38873 ERG10YPL028W 1197 nt13.41□□□□□ -0.26
KOG1P38873 YGL081WYGL081W 963 nt13.41□□□□□ -0.26
KOG1P38873 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt13.41□□□□□ -0.26
KOG1P38873 FYV1YDR024W 486 nt13.4□□□□□ -0.26
KOG1P38873 YML122CYML122C 381 nt13.4□□□□□ -0.26
KOG1P38873 TIM50YPL063W 1431 nt13.39□□□□□ -0.27
KOG1P38873 NMA2YGR010W 1188 nt13.37□□□□□ -0.27
KOG1P38873 TIF3YPR163C 1311 nt13.36□□□□□ -0.27
KOG1P38873 YKL153WYKL153W 510 nt13.36□□□□□ -0.27
KOG1P38873 MSI1YBR195C 1269 nt13.35□□□□□ -0.27
KOG1P38873 YJR142WYJR142W 1029 nt13.34□□□□□ -0.27
KOG1P38873 CDC3YLR314C 1563 nt13.34□□□□□ -0.27
KOG1P38873 PDA1YER178W 1263 nt13.33□□□□□ -0.28
KOG1P38873 LSR1LSR1 1175 nt13.33□□□□□ -0.28
KOG1P38873 UME6YDR207C 2511 nt13.33□□□□□ -0.28
KOG1P38873 FCY22YER060W-A 1593 nt13.32□□□□□ -0.28
KOG1P38873 PRE10YOR362C 867 nt13.32□□□□□ -0.28
KOG1P38873 MED6YHR058C 888 nt13.28□□□□□ -0.28
KOG1P38873 OPI10YOL032W 741 nt13.28□□□□□ -0.28
KOG1P38873 MRPL35YDR322W 1104 nt13.28□□□□□ -0.28
KOG1P38873 ERV2YPR037C 591 nt13.28□□□□□ -0.28
KOG1P38873 SNX3YOR357C 489 nt13.27□□□□□ -0.29
KOG1P38873 PAB1YER165W 1734 nt13.26□□□□□ -0.29
KOG1P38873 DRE2YKR071C 1047 nt13.25□□□□□ -0.29
KOG1P38873 MRPL19YNL185C 477 nt13.24□□□□□ -0.29
KOG1P38873 GPD1YDL022W 1176 nt13.23□□□□□ -0.29
KOG1P38873 YIR035CYIR035C 765 nt13.22□□□□□ -0.29
KOG1P38873 LIA1YJR070C 978 nt13.22□□□□□ -0.29
KOG1P38873 snR30snR30 606 nt13.22□□□□□ -0.29
KOG1P38873 SML1YML058W 315 nt13.21□□□□□ -0.29
KOG1P38873 YDL144CYDL144C 1071 nt13.2□□□□□ -0.3
KOG1P38873 STS1YIR011C 960 nt13.18□□□□□ -0.3
KOG1P38873 YOR325WYOR325W 474 nt13.18□□□□□ -0.3
KOG1P38873 YAT1YAR035W 2064 nt13.17□□□□□ -0.3
KOG1P38873 CIA1YDR267C 993 nt13.16□□□□□ -0.3
KOG1P38873 OPI1YHL020C 1215 nt13.16□□□□□ -0.3
KOG1P38873 IMG1YCR046C 510 nt13.15□□□□□ -0.3
KOG1P38873 GLY1YEL046C 1164 nt13.14□□□□□ -0.31
KOG1P38873 FPR3YML074C 1236 nt13.14□□□□□ -0.31
KOG1P38873 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt13.14□□□□□ -0.31
KOG1P38873 HXT8YJL214W 1710 nt13.13□□□□□ -0.31
KOG1P38873 YLR162WYLR162W 357 nt13.13□□□□□ -0.31
KOG1P38873 DPM1YPR183W 804 nt13.11□□□□□ -0.31
KOG1P38873 NAR1YNL240C 1476 nt13.11□□□□□ -0.31
KOG1P38873 TES1YJR019C 1050 nt13.11□□□□□ -0.31
KOG1P38873 ALG12YNR030W 1656 nt13.09□□□□□ -0.31
KOG1P38873 FSF1YOR271C 984 nt13.09□□□□□ -0.31
KOG1P38873 OSM1YJR051W 1506 nt13.09□□□□□ -0.31
KOG1P38873 BUB2YMR055C 921 nt13.08□□□□□ -0.32
KOG1P38873 NAF1YNL124W 1479 nt13.08□□□□□ -0.32
KOG1P38873 AGP3YFL055W 1677 nt13.07□□□□□ -0.32
KOG1P38873 GGA2YHR108W 1758 nt13.07□□□□□ -0.32
KOG1P38873 SSC1YJR045C 1965 nt13.06□□□□□ -0.32
KOG1P38873 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt13.06□□□□□ -0.32
KOG1P38873 YLR463CYLR463C 552 nt13.06□□□□□ -0.32
KOG1P38873 PSA1YDL055C 1086 nt13.05□□□□□ -0.32
KOG1P38873 GID8YMR135C 1368 nt13.05□□□□□ -0.32
KOG1P38873 THI3YDL080C 1830 nt13.04□□□□□ -0.32
KOG1P38873 DMA2YNL116W 1569 nt13.03□□□□□ -0.32
KOG1P38873 YIP4YGL198W 708 nt13.03□□□□□ -0.32
KOG1P38873 RDN25-1RDN25-1 3396 nt13.03□□□□□ -0.32
KOG1P38873 RDN25-2RDN25-2 3396 nt13.03□□□□□ -0.32
KOG1P38873 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt13.03□□□□□ -0.32
KOG1P38873 COQ3YOL096C 939 nt13.03□□□□□ -0.32
KOG1P38873 ODC1YPL134C 933 nt13.03□□□□□ -0.32
KOG1P38873 ILV6YCL009C 930 nt13.02□□□□□ -0.33
KOG1P38873 DST1YGL043W 930 nt13.01□□□□□ -0.33
KOG1P38873 ARG7YMR062C 1326 nt13.01□□□□□ -0.33
KOG1P38873 DML1YMR211W 1428 nt13□□□□□ -0.33
KOG1P38873 TMS1YDR105C 1422 nt12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 111.3 ms