Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1BP36896 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1BP36896 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACVR1BP36896 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACVR1BP36896 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACVR1BP36896 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACVR1BP36896 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACVR1BP36896 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACVR1BP36896 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACVR1BP36896 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACVR1BP36896 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACVR1BP36896 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACVR1BP36896 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms