Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 TOS1YBR162C 1368 nt10.62□□□□□ -0.71
CSE4P36012 SBP1YHL034C 885 nt10.61□□□□□ -0.71
CSE4P36012 OCH1YGL038C 1443 nt10.6□□□□□ -0.71
CSE4P36012 CWP2YKL096W-A 279 nt10.6□□□□□ -0.71
CSE4P36012 ADE1YAR015W 921 nt10.59□□□□□ -0.71
CSE4P36012 KDX1YKL161C 1302 nt10.58□□□□□ -0.71
CSE4P36012 BAP3YDR046C 1815 nt10.58□□□□□ -0.72
CSE4P36012 MET22YOL064C 1074 nt10.58□□□□□ -0.72
CSE4P36012 SKG1YKR100C 1068 nt10.57□□□□□ -0.72
CSE4P36012 YLR460CYLR460C 1131 nt10.56□□□□□ -0.72
CSE4P36012 DPL1YDR294C 1770 nt10.55□□□□□ -0.72
CSE4P36012 BXI1YNL305C 894 nt10.55□□□□□ -0.72
CSE4P36012 RPS6AYPL090C 711 nt10.55□□□□□ -0.72
CSE4P36012 RPS6BYBR181C 711 nt10.55□□□□□ -0.72
CSE4P36012 FUS3YBL016W 1062 nt10.54□□□□□ -0.72
CSE4P36012 PRE5YMR314W 705 nt10.54□□□□□ -0.72
CSE4P36012 Q0144Q0144 330 nt10.53□□□□□ -0.72
CSE4P36012 CHS7YHR142W 951 nt10.53□□□□□ -0.72
CSE4P36012 YJL043WYJL043W 774 nt10.52□□□□□ -0.73
CSE4P36012 PET20YPL159C 762 nt10.52□□□□□ -0.73
CSE4P36012 YPL247CYPL247C 1572 nt10.52□□□□□ -0.73
CSE4P36012 RPC31YNL151C 756 nt10.51□□□□□ -0.73
CSE4P36012 YMR209CYMR209C 1374 nt10.51□□□□□ -0.73
CSE4P36012 YPR084WYPR084W 1371 nt10.51□□□□□ -0.73
CSE4P36012 PDC6YGR087C 1692 nt10.5□□□□□ -0.73
CSE4P36012 YDR509WYDR509W 348 nt10.5□□□□□ -0.73
CSE4P36012 SDH8YBR269C 417 nt10.5□□□□□ -0.73
CSE4P36012 PET494YNR045W 1470 nt10.49□□□□□ -0.73
CSE4P36012 TDH1YJL052W 999 nt10.49□□□□□ -0.73
CSE4P36012 RNA170RNA170 169 nt10.49□□□□□ -0.73
CSE4P36012 ATP2YJR121W 1536 nt10.48□□□□□ -0.73
CSE4P36012 NUP53YMR153W 1428 nt10.48□□□□□ -0.73
CSE4P36012 KRR1YCL059C 951 nt10.47□□□□□ -0.73
CSE4P36012 snR78snR78 87 nt10.46□□□□□ -0.73
CSE4P36012 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.46□□□□□ -0.73
CSE4P36012 MDM35YKL053C-A 261 nt10.45□□□□□ -0.74
CSE4P36012 SWP1YMR149W 861 nt10.45□□□□□ -0.74
CSE4P36012 OLA1YBR025C 1185 nt10.44□□□□□ -0.74
CSE4P36012 THI3YDL080C 1830 nt10.43□□□□□ -0.74
CSE4P36012 YJL107CYJL107C 1164 nt10.43□□□□□ -0.74
CSE4P36012 AST1YBL069W 1290 nt10.42□□□□□ -0.74
CSE4P36012 GGA2YHR108W 1758 nt10.42□□□□□ -0.74
CSE4P36012 YNL165WYNL165W 1221 nt10.4□□□□□ -0.74
CSE4P36012 YNR068CYNR068C 819 nt10.4□□□□□ -0.74
CSE4P36012 DMA2YNL116W 1569 nt10.39□□□□□ -0.75
CSE4P36012 HOS2YGL194C 1359 nt10.39□□□□□ -0.75
CSE4P36012 YPT31YER031C 672 nt10.38□□□□□ -0.75
CSE4P36012 LEU4YNL104C 1860 nt10.38□□□□□ -0.75
CSE4P36012 YIL168WYIL168W 384 nt10.37□□□□□ -0.75
CSE4P36012 MAS1YLR163C 1389 nt10.35□□□□□ -0.75
CSE4P36012 YIR035CYIR035C 765 nt10.34□□□□□ -0.75
CSE4P36012 RSM23YGL129C 1353 nt10.34□□□□□ -0.75
CSE4P36012 HXT10YFL011W 1641 nt10.33□□□□□ -0.76
CSE4P36012 GPM1YKL152C 744 nt10.33□□□□□ -0.76
CSE4P36012 RHO1YPR165W 630 nt10.33□□□□□ -0.76
CSE4P36012 YHR218WYHR218W 1812 nt10.33□□□□□ -0.76
CSE4P36012 URE2YNL229C 1065 nt10.31□□□□□ -0.76
CSE4P36012 HEL2YDR266C 1920 nt10.31□□□□□ -0.76
CSE4P36012 EEB1YPL095C 1371 nt10.3□□□□□ -0.76
CSE4P36012 RPR1RPR1 369 nt10.3□□□□□ -0.76
CSE4P36012 RRT6YGL146C 936 nt10.29□□□□□ -0.76
CSE4P36012 TMS1YDR105C 1422 nt10.28□□□□□ -0.76
CSE4P36012 YDR476CYDR476C 675 nt10.28□□□□□ -0.76
CSE4P36012 AAC3YBR085W 924 nt10.28□□□□□ -0.76
CSE4P36012 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt10.27□□□□□ -0.77
CSE4P36012 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt10.27□□□□□ -0.77
CSE4P36012 YJL211CYJL211C 444 nt10.27□□□□□ -0.77
CSE4P36012 SHC1YER096W 1539 nt10.27□□□□□ -0.77
CSE4P36012 PSP2YML017W 1782 nt10.26□□□□□ -0.77
CSE4P36012 APM1YPL259C 1428 nt10.26□□□□□ -0.77
CSE4P36012 PIC2YER053C 903 nt10.26□□□□□ -0.77
CSE4P36012 RMA1YKL132C 1293 nt10.26□□□□□ -0.77
CSE4P36012 YMR147WYMR147W 672 nt10.26□□□□□ -0.77
CSE4P36012 SCO2YBR024W 906 nt10.26□□□□□ -0.77
CSE4P36012 THI73YLR004C 1572 nt10.26□□□□□ -0.77
CSE4P36012 AGP3YFL055W 1677 nt10.25□□□□□ -0.77
CSE4P36012 COX16YJL003W 357 nt10.25□□□□□ -0.77
CSE4P36012 YCR099CYCR099C 468 nt10.24□□□□□ -0.77
CSE4P36012 YDR467CYDR467C 327 nt10.24□□□□□ -0.77
CSE4P36012 PUP3YER094C 618 nt10.24□□□□□ -0.77
CSE4P36012 HAC1YFL031W 717 nt10.24□□□□□ -0.77
CSE4P36012 YGL118CYGL118C 438 nt10.24□□□□□ -0.77
CSE4P36012 BUB2YMR055C 921 nt10.24□□□□□ -0.77
CSE4P36012 PSD1YNL169C 1503 nt10.23□□□□□ -0.77
CSE4P36012 COS10YNR075W 1125 nt10.23□□□□□ -0.77
CSE4P36012 JHD1YER051W 1479 nt10.23□□□□□ -0.77
CSE4P36012 YLR358CYLR358C 564 nt10.22□□□□□ -0.77
CSE4P36012 NPP2YEL016C 1482 nt10.22□□□□□ -0.77
CSE4P36012 BSP1YPR171W 1731 nt10.21□□□□□ -0.78
CSE4P36012 PMU1YKL128C 888 nt10.2□□□□□ -0.78
CSE4P36012 NAT5YOR253W 531 nt10.2□□□□□ -0.78
CSE4P36012 TIM50YPL063W 1431 nt10.19□□□□□ -0.78
CSE4P36012 YBL081WYBL081W 1107 nt10.19□□□□□ -0.78
CSE4P36012 MOD5YOR274W 1287 nt10.19□□□□□ -0.78
CSE4P36012 YEL074WYEL074W 339 nt10.18□□□□□ -0.78
CSE4P36012 ICE2YIL090W 1476 nt10.17□□□□□ -0.78
CSE4P36012 PUP2YGR253C 783 nt10.17□□□□□ -0.78
CSE4P36012 YML079WYML079W 606 nt10.17□□□□□ -0.78
CSE4P36012 YBR056WYBR056W 1506 nt10.17□□□□□ -0.78
CSE4P36012 CPT1YNL130C 1182 nt10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.7 ms