Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALRP27797 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALRP27797 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALRP27797 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALRP27797 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALRP27797 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALRP27797 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALRP27797 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALRP27797 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALRP27797 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALRP27797 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALRP27797 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALRP27797 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALRP27797 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALRP27797 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALRP27797 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALRP27797 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALRP27797 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALRP27797 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALRP27797 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALRP27797 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALRP27797 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALRP27797 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALRP27797 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALRP27797 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALRP27797 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALRP27797 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALRP27797 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALRP27797 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALRP27797 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALRP27797 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALRP27797 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALRP27797 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALRP27797 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALRP27797 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALRP27797 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALRP27797 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALRP27797 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALRP27797 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALRP27797 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALRP27797 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALRP27797 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALRP27797 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALRP27797 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALRP27797 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALRP27797 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALRP27797 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALRP27797 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALRP27797 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALRP27797 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALRP27797 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALRP27797 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALRP27797 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALRP27797 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALRP27797 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALRP27797 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CALRP27797 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALRP27797 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALRP27797 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALRP27797 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALRP27797 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALRP27797 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALRP27797 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALRP27797 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALRP27797 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALRP27797 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALRP27797 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALRP27797 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALRP27797 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALRP27797 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALRP27797 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALRP27797 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALRP27797 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALRP27797 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALRP27797 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALRP27797 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALRP27797 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALRP27797 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALRP27797 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALRP27797 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALRP27797 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALRP27797 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALRP27797 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALRP27797 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALRP27797 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALRP27797 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALRP27797 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALRP27797 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALRP27797 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALRP27797 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALRP27797 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALRP27797 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALRP27797 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALRP27797 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALRP27797 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALRP27797 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALRP27797 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALRP27797 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALRP27797 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALRP27797 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms